Все сканеры SkyScan оснащены программным пакетом для полного 2D и 3D количественного анализа реконструированных объемов из микротомографий, программой "CT-анализатор" и программой реалистичной 3D визуализации сканируемых объектов - программой "CT-volume". Эти программы могут выполняться на входящей в комплект поставки рабочей станции или на любом настольном компьютере или ноутбуке вашей лаборатории.

SkyScan "CT-анализатор" анализирует наборы данных микротомографии для морфометрии и денситометрии. Это интуитивно понятная и всеобъемлющая среда для обработки и анализа наборов данных, позволяющая получать точные количественные данные, что является конечной целью микротомографии и анализа.

Реконструированный набор фрагментов может быть просмотрен в программе SkyScan "Data Viewer". Изображения отображаются в виде фрагмента за фрагментом или в виде трех ортогональных участков, центрированных в любой выбранной точке реконструируемого пространства. Data Viewer также имеет режим просмотра с тремя пересекающимися ортогональными секциями, которые можно поворачивать и каждый пересекающийся срез перемещать с помощью простой мыши.

Дополнительные функции включают в себя переменное сглаживание, сохранение интерполированных наборов данных в сагитальном или корональном сечении, измерение и сохранение расстояний и профилей интенсивности. Утилита форматирования "T-conv" конвертирует между собой файлы форматов TIFF, BMP и JPEG с настройкой цветовой палитры, инверсии, переименования, изменения размеров и комбинирования наборов данных. Предусмотрена также утилита для конвертирования в формат DICOM 3.